試料・情報の保管状況について Specimen Collection
バイオバンクで保管する試料・情報の概要
当バイオバンクで保管する試料・情報は以下の通りです。
| 項目 | 収集対象 |
|---|---|
| 生体試料 | DNA、血清、血漿、尿、母乳、単核球、EBV不死化細胞、増殖T細胞 |
| 情報 | コホート調査における調査票情報、検体検査情報、生理機能検査情報、MRI検査情報、ゲノム配列情報、メタボローム情報、母子手帳情報 |
試料・情報の保管状況
東北メディカル・メガバンク計画では2013年5月から生体試料の収集を開始しました。2017年6月末までに15万人の試料・情報を収集しました。
試料・情報の保管方法
当バイオバンクで収集する試料の保管の方法は以下の通りです。
DNA
血漿・血清・母乳
血液細胞(単核球)
細胞試料
尿
| 保管チューブ | Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes |
|---|---|
| 分注量・分注数 | 50ng/ul x 200ulに調整後50ulずつ分譲 |
| 保管温度 | 4℃ 長期保存は-80℃ |
| 抽出の方法 | QIAGEN社Autopure LS |
| 定量の方法 | Quant-iT PicoGreen dsDNA Assay Kit |
| 品質チェック | O.D.260/280 |
| 溶媒の種類 | DNA Hydration solution(TE） |
| 分譲用チューブ | Abgene社0.8 mL deepwell storage plate |
| 保管チューブ | Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes |
|---|---|
| 分注量・分注数 | 700ul x 4本 |
| 保管温度 | -80℃ |
| 保管チューブ | Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes |
|---|---|
| 分注量・分注数 | 500ul(血液2.5ml相当) x 3本 |
| 保管温度 | 液体窒素 |
| 単核球 分離方法 | 東北メディカル・メガバンク計画（TMM）のコホート参加者の末梢血（5ml、または7ml）、臍帯血（8ml）を採血日当日、または翌日に密度勾配遠心法にて分離。分離後の単核球はセルバンカーに懸濁後、末梢血は2本（5ml）または3本（7ml）、臍帯血は4本の2Dチューブに分注し、バイセルまたはプログラムフリーザーにて-80℃に凍結保管。1晩以上置いた後に液体窒素気相に保管。 |
| 保管チューブ | Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes |
|---|---|
| 分注量 (細胞数) | 500µl (≧ 2x10^6 cells) |
| 保管条件 | 液体窒素気相 |
| EBV不死化細胞 作成方法 | 単核球より分離したCD19陽性細胞（B細胞）に、Epstein-Barr virus (EBV)を感染させ、下記の培地で増殖 【培地組成】 最終濃度20％ Fetal Bovine Serum (FBS, 非働化)、0.1mM Non- Essential amino acids、2mM GlutaMax、0.5mg/mL Penicillin/Streptomycinを添加したRPMI1640培地 |
| 増殖T細胞 作成方法 | 単核球より分離したCD19陰性細胞（T細胞を多く含む）を、抗CD3/CD28抗体でT細胞を活性化させ、下記の培地で増殖 【培地組成】 EBV不死化細胞と同じ培地にIL-2（最終濃度 30U/mL）を要時添加 |
| 保管チューブ | Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes |
|---|---|
| 分注量・分注数 | 700ul x 3本 |
| 保管温度 | -80℃ |
各々の検体の処理、入出庫の管理はLABVANTAGE Solutions社のLabVantageをカスタマイズしたLIMSを使用し上記2Dチューブのバーコードを利用して行っています。また、血液細胞以外の試料の分注はTECAN社のFreedom EVO自動分注機を用いて自動化しています。
当バイオバンクで収集する情報である、検体検査情報、調査票情報、生理機能検査情報、MRI検査情報、ゲノム配列情報、メタボローム情報、診療・介護情報は、匿名化されたうえで、スーパーコンピュータのデータバンク区画にある統合データベースに保管しています。