試料・情報の保管状況について Specimen Collection

バイオバンクで保管する試料・情報の概要

当バイオバンクで保管する試料・情報は以下の通りです。

項目 収集対象
生体試料 DNA、血清、血漿、血液細胞、尿
情報 コホート調査における調査票情報 (調査疾患名は別表1を参照)、血液・尿検査情報、生理学検査情報、MRI検査情報、ゲノム配列情報、オミックス情報、診療・介護情報

試料・情報の保管状況

東北メディカル・メガバンク機構では2013年5月から生体試料の収集を開始しました。試料の提供者実数は2016年8月で約 145,000人です。平成28年度末までに15万人の試料・情報の収集を終える予定です。

試料・情報の保管方法

当バイオバンクで収集する試料の保管の方法は以下の通りです。

DNA
血漿・血清
バフィーコート
血液細胞(単核球)
尿
細胞試料
DNA
保管チューブ Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes
分注量・分注数 50ng/ul x 200ulに調整後50ulずつ分譲
保管温度 4℃ 長期保存は-80℃
抽出の方法 QIAGEN社Autopure LS
定量の方法 Quant-iT PicoGreen dsDNA Assay Kit
品質チェック O.D.260/280
溶媒の種類 DNA Hydration solution(TE)
分譲用チューブ Abgene社0.8 mL deepwell storage plate
血漿・血清
保管チューブ Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes
分注量・分注数 700ul x 4本
保管温度 -80℃
バフィーコート
分譲の予定はない
血液細胞(単核球)
保管チューブ Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes
分注量・分注数 500ul(血液2.5ml相当) x 2本
保管温度 液体窒素
尿
保管チューブ Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes
分注量・分注数 700ul x 3本
保管温度 -80℃
細胞試料
保管チューブ Thermo Scientific社 Matrix 2D Barcoded Storage Tubes
分注量 (細胞数) 500µl (≧ 2x10^6 cells)
保管条件 液体窒素気相
EBV不死化細胞 作成方法 単核球より分離したCD19陽性細胞(B細胞)に、Epstein-Barr virus (EBV)を感染させ、下記の培地で増殖
【培地組成】 最終濃度20% Fetal Bovine Serum (FBS, 非働化)、0.1mM Non- Essential amino acids、2mM GlutaMax、0.5mg/mL Penicillin/Streptomycinを添加したRPMI1640培地
増殖T細胞 作成方法 単核球より分離したCD19陰性細胞(T細胞を多く含む)を、抗CD3/CD28抗体でT細胞を活性化させ、下記の培地で増殖
【培地組成】 EBV不死化細胞と同じ培地にIL-2(最終濃度 30U/mL)を要時添加

各々の検体の処理、入出庫の管理はLABVANTAGE Solutions社のLabVantageをカスタマイズしたLIMSを使用し上記2Dチューブのバーコードを利用して行っています。また、血液細胞以外の試料の分注はTECAN社のFreedom EVO自動分注機を用いて自動化しています。

当バイオバンクで収集する情報である、血液・尿検査情報、調査票情報、生理学検査情報、MRI検査情報、ゲノム配列情報、オミックス情報、診療・介護情報は、匿名化されたうえで、スーパーコンピュータのデータバンク区画にある統合データベースに保管しています。

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