研究成果発表するときには Notification
当バイオバンクから分譲された研究試料・情報を用いて得られた研究成果に基づく論文発表を行う場合について
当バイオバンクから分譲された研究試料及び情報を使用して得られた研究成果を論文等の形で公表する場合若しくは公的なデータベース等に登録して公開する等の方法により公開する場合には、当該研究試料及び情報が当バイオバンクの貢献により収集されたことを記した論文を参照文献として記載する等、合理的かつ相当な方法で当該研究成果と当バイオバンクとの関係を明示することをお願いしております。
試料や情報について、当機構から分譲を受けたことを、研究番号を添えて記述してください。
記載例
In this study, *** samples, cohort information, and genome data were provided by the Tohoku Medical Megabank (TMM) Project (research number: 20xx-xxxx).
全ての分譲データは、東北メディカル・メガバンク計画スーパーコンピュータの利用によるものです。当機構のスーパーコンピュータは、ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム（B-Cure） 基盤事業としてサポートされています。論文を出す際にはB-cure 基盤事業に関する謝辞をお願いします。
This research was supported (in part) by the Japan Agency for Medical Research and development, AMED under Grant Number JP21tm0424601.
提供している試料・情報と関連論文 (2024年5月時点)
| カテゴリ | 内容 | 論文 | PubMed |
|---|---|---|---|
| デザイン | 東北メディカル•メガバンク計画 | Kuriyama, S. et al. The Tohoku Medical Megabank Project: Design and Mission. J Epidemiol 26, 493–511 (2016). | Link |
| デザイン | 地域住民コホート調査 | Hozawa, A. et al. Study Profile of the Tohoku Medical Megabank Community-Based Cohort Study. J Epidemiol 31, 65–76 (2021). | Link |
| デザイン | 地域住民コホート第２段階調査調査 | Hozawa A. Nakaya K et al. Progress report of the Tohoku Medical Megabank Community-Based Cohort Study: Study profile of the repeated center-based survey during second period in Miyagi Prefecture. 2024 Feb 24. doi: 10.2188/jea.JE20230241. Online ahead of print. | Link |
| デザイン | 三世代コホート調査 | Kuriyama, S. et al. Cohort Profile: Tohoku Medical Megabank Project Birth and Three-Generation Cohort Study (TMM BirThree Cohort Study): rationale, progress and perspective. Int J Epidemiol 49, 18–19m (2020). | Link |
| デザイン | 複合バイオバンク | Fuse, N. et al. Establishment of Integrated Biobank for Precision Medicine and Personalized Healthcare: The Tohoku Medical Megabank Project. JMA J. 2019;2(2):113-122. | Link |
| デザイン | ゲノム解析 | Yasuda, J. et al. Genome analyses for the Tohoku Medical Megabank Project towards establishment of personalized healthcare. J Biochem 165, 139–158 (2019). | Link |
| 試料 | バイオバンク | Minegishi, N. et al. Biobank Establishment and Sample Management in the Tohoku Medical Megabank Project. The Tohoku Journal of Experimental Medicine 248, 45–55 (2019). | Link |
| 試料 | 細胞試料 | Ishida, N. et al. Landscape of electrophilic and inflammatory stress-mediated gene regulation in human lymphoblastoid cell lines. Free Radical Bio Med 161, 71–83 (2020). | Link |
| 情報 | 全ゲノム配列情報 | Tadaka, S. et al. 3.5KJPNv2: an allele frequency panel of 3552 Japanese individuals including the X chromosome. Hum Genome Var 6, 28 (2019). | Link |
| 情報 | 全ゲノム配列情報 | Nagasaki, M. et al. Rare variant discovery by deep whole-genome sequencing of 1,070 Japanese individuals. Nat Commun 6, 8018 (2015). | Link |
| 情報 | SNPアレイ情報 ジャポニカアレイ | Sakurai-Yageta, M. et al. Japonica Array NEO with increased genome-wide coverage and abundant disease risk SNPs. J Biochem mvab060 (2021) | Link |
| 情報 | SNPアレイ情報 ジャポニカアレイ | Kawai, Y. et al. Japonica array: improved genotype imputation by designing a population-specific SNP array with 1070 Japanese individuals. J Hum Genet 60, 581–587 (2015). | Link |
| 情報 | メチル化解析 | Hachiya, T.et al. Genome-wide identification of inter-individually variable DNA methylation sites improves the efficacy of epigenetic association studies. npj Genomic Med 2, 11 (2017). | Link |
| 情報 | オミックス解析情報（メタボローム、プロテオーム） | Koshiba, S. et al. Omics research project on prospective cohort studies from the Tohoku Medical Megabank Project. Genes Cells 23, 406–417 (2018). | Link |
| 情報 | メタボローム解析情報 | Koshiba, S. et al. The structural origin of metabolic quantitative diversity. Scientific Reports 6, srep31463 (2016). | Link |
| 情報 | メタボローム解析情報 | Koshiba, S. et al. Identification of critical genetic variants associated with metabolic phenotypes of the Japanese population. Commun Biology 3, 662 (2020). | Link |
| 情報 | 口腔マイクロバイオーム解析情報 | Saito, S. et al. Oral Microbiome Analysis in Prospective Genome Cohort Studies of the Tohoku Medical Megabank Project. Front Cell Infect Mi 10, 604596 (2021). | Link |
| 情報 | MRI（脳画像）検査情報 | Taira, M. et al. Tohoku Medical Megabank Brain Magnetic Resonance Imaging Study: Rationale, Design, and Background. JMA J. 2023;6(3):246-264. | Link |
| データベース | dbTMM | Ogishima, S. et al. dbTMM: an integrated database of large-scale cohort, genome and clinical data for the Tohoku Medical Megabank Project. Hum Genome Var 8, 44 (2021). | Link |
| データベース | jMorp | Tadaka, S. et al. jMorp: Japanese Multi-Omics Reference Panel update report 2023. Nucleic Acids Res (2023) AOP | Link |
| データベース | iMethyl DNAメチル化情報 | Komaki, S. et al. iMETHYL: an integrative database of human DNA methylation, gene expression, and genomic variation. Hum Genome Var 5, 18008 (2018). | Link |
| ゲノム解析関連 | ゲノム解析技術 | Katsuoka, F. et al. An efficient quantitation method of next-generation sequencing libraries by using MiSeq sequencer. Anal Biochem 466, 27–29 (2014). | Link |
| ゲノム解析関連 | 長鎖リードシークエンサーを用いた遺伝子発現解析 | Otsuki, A. et al. Identification of Dominant Transcripts in Oxidative Stress Response by a Full-Length Transcriptome Analysis. Mol Cell Biol 41, (2021). | Link |
| ゲノム解析関連 | 地域差検証 | Yasuda, J. et al. Regional genetic differences among Japanese populations and performance of genotype imputation using whole-genome reference panel of the Tohoku Medical Megabank Project. BMC Genomics 19, 551 (2018). | Link |
| ゲノム解析関連 | 日本人標準ゲノム(JG1) | Takayama, J. et al. Construction and integration of three de novo Japanese human genome assemblies toward a population-specific reference. Nat Commun 12, 226 (2021). | Link |
| ゲノム解析関連 | 遺伝地図の構築 | Takayama, J. et al. A fine-scale genetic map of the Japanese population. Clin Genet. 2024 May 8. Online ahead of print. | Link |