東北メディカル・メガバンク 統合データベースdbTMMカタログ dbTMM Catalogue

2.0.2 AMED先端ゲノム研究開発(GRIFIN)Japonica v2解析情報およびメタボローム情報/呼気NOデータ/口腔マイクロバイオーム解析情報 26K (2020年11月30日リリース)

本カタログは、約15,000人分のJaponica v2 SNPアレイ情報、約13,000人分の呼気NOデータ、約1,600人分のNMR/MSメタボローム解析情報、約1,200人分の口腔マイクロバイオーム解析情報、および基本情報、健康調査情報 調査票(生活)既往歴を格納した東北メディカル・メガバンク 統合データベース dbTMMのリリースである2.0.2版のdbTMM カタログです。
格納されているすべての基本情報、調査票(生活)既往歴の項目、生理機能検査情報の項目、データ数等の統計量、分布等のグラフを閲覧することができます。
本カタログの統計量、グラフは、約26,000人の基本情報、調査票(生活)既往歴、呼気NOデータについて、欠損と無回答を除いたデータから作成されました。
なお、本リリースのSNPアレイ情報、NMR/MSメタボローム解析情報、呼気NOデータ、口腔マイクロバイオーム解析情報は、AMED先端ゲノム研究開発(GRIFIN)の「多因子疾患の個別化予防・医療を実現するための公開統合ゲノム情報基盤の構築」の研究開発において解析されたものを含みます。

基本情報の項目について

基本情報として分譲する情報は以下の2項目です。

健康調査情報の項目について

健康調査情報として分譲する情報は以下の2種類です。

項目 収集対象
調査票(生活)情報 既往症
生理機能検査情報 呼気NOデータ

調査票(生活)情報の項目

生理機能検査情報の項目

SNPアレイ情報について

SNPアレイ情報として分譲する情報はToMMo全ゲノムリファレンスパネルでインピュテーションした個人毎の一塩基多型です。

プラットフォーム 人数
Japonica v2アレイ 15,133人

オミックス情報について

メタボローム解析情報について

プラットフォーム 人数
NMRメタボローム(定量) 1,615人
MSメタボローム(半定量) 596人

口腔マイクロバイオーム解析情報について

プラットフォーム 人数
口腔マイクロバイオーム 1,288人

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